Este artigo faz um estudo de caso de duas bibliotecas livres no processamento de imagens médicas: VTK e ITK. Serão abordados aspectos gerais das bibliotecas bem como aplicativos que foram e vêm sendo desenvolvidos no processamento de imagens médicas, próprios ou de terceiros, que fazem uso das bibliotecas. Nossos trabalhos apresentados serão disponibilizados como software livre no auxílio ao diagnóstico e na pesquisa médica.